عمل پانکچر تخمدان معمولاً در یک مرکز ناباروری و تحت بی‌حسی موضعی یا بیهوشی سبک انجام می‌شود. مراحل انجام این عمل به شرح زیر است:

1. آماده‌سازی بیمار: بیمار باید چند ساعت قبل از عمل ناشتا باشد. همچنین پزشک ممکن است آنتی‌بیوتیک یا آرام‌بخش تجویز کند.

2. هدایت سونوگرافی: پزشک با استفاده از سونوگرافی واژینال، موقعیت فولیکول‌های حاوی تخمک را مشخص می‌کند.

3. ورود سوزن مخصوص: یک سوزن نازک و مخصوص از طریق دیواره واژن وارد تخمدان شده و فولیکول‌ها را تخلیه می‌کند.

4. جمع‌آوری تخمک‌ها: مایع فولیکولی که حاوی تخمک است به آزمایشگاه ارسال می‌شود تا تخمک‌ها از آن جداسازی شوند.

5. بازیابی و بررسی تخمک‌ها: جنین‌شناسان تخمک‌ها را بررسی کرده و برای لقاح آماده می‌کنند.